Deniz ve Göllerde yapılan 1/40 000 ve daha büyük ölçekli Hidrografik haritalardır. Seyir amaçları yanında, sualtı ve su kıyısında yapılacak araştırma, inşaat ve işletme hizmetleri için çok yönlü kullanılma amaçları vardır. Özel haritalar sınıfına giren haritalardan bazıları şunlardır :

1) Liman haritaları,

2) Gemi demirleme sahalarına ait haritalar,

3) Boğaz ve su yolu (kanal) haritaları,

4) Doğal ve yapay göl haritaları,

5) Özel araştırma haritaları,

6) Askeri amaçlı haritalar vb.

Özel haritalar genellikle amaca uygun projeksiyon yöntemine göre çizilirler ve gereksinilen ayrıntıyı kapsarlar. Ancak bunların büyük çoğunluğunda sualtı zemininin ve kıyının topoğrafik durumu açık olarak gösterilmiştir. (Şekil 5), bir akarsuyun denize döküldüğü bölgenin kara ve deniz ayrıntılarını belirten bir Amerikan Deniz (nautik) haritasına ait bir örnektir.